Endodoncja jest działem stomatologii zachowawczej, w którym główną metodą leczenia jest tak zwane leczenie kanałowe. Wskazaniami do tego typu zabiegu są mocno zaawansowane stany próchnicze, zapalenie i martwica miazgi zębowej oraz wymogi protetyczne. Leczenie kanałowe przeprowadza się więc również przed wykonaniem korony lub mostu.
Endodoncja niezbędna jest przy nieodwracalnym uszkodzeniu lub stanie zapalnym nerwu, których przyczyną mogą być na przykład wspomniane już głębokie stany próchnicze albo złamanie, uszkodzenie lub inne urazy zębów, a także częste ich leczenie. W takim przypadku endodoncja polega na usunięciu z kanału bakterii oraz pozostałości nerwu i uszczelnieniu kanału specjalnym materiałem (glutaperką). Jest to konieczne, aby uniemożliwić bakteriom przemieszczanie się i infekowanie kości w okolicy zęba. Po przeprowadzeniu leczenia endodontycznego, możliwe jest dalsze leczenie zębów, czyli odbudowa ich korony.